Nach einem Studium am Leipziger Konservatorium wechselte er 1920 zur Hochschule für Musik nach Berlin. Er beendete seine Ausbildung 1923 und verdiente sich bis 1925 als Caféhaus- und Kinopianist seinen Lebensunterhalt. Dann erhielt er ein Engagement als Kapellmeister bei Rudolf von Laban (1879–1958) und begann mit dem Bühnenbildner Caspar Neher (1897–1962) zusammenzuarbeiten. Ab 1930 wirkte Wagner-Régeny als freischaffender Komponist. Während seines Dienstes in der Wehrmacht war er Schreiber und Musiker. 1946 arbeitete er am Theater in Güstrow. 1947–1950 war Wagner-Régeny Rektor der Hochschule für Musik in Rostock. 1950 erhielt er an der Hochschule für Musik in Berlin eine Professur für Komposition, er lehrte dort bis 1967. 1950 wurde Wagner-Régeny Mitglied der Deutschen Akademie der Künste (später Akademie der Künste der DDR), und 1958 wurde er in die Akademie der Künste (West-Berlin) aufgenommen. Zu seinem kompositorischen Werk zählen 13 Opern, Ballette, Orchester- und Kammermusik. Wagner-Régeny erhielt in Mitte auf dem Dorotheenstädtisch-Friedrichswerderschen Friedhof I (evangelisch), Chausseestraße 126, ein Ehrengrab.