Wutzky absolvierte eine Schriftsetzerlehre und wirkte dann als Funktionär im Deutschen Buchdruckerverband. Im Jahre 1898 wurde er in die Stadtverordnetenversammlung von Rixdorf gewählt. Zu dieser Zeit arbeitete er in Berlin beim "Vorwärts". 1902-1906 war Wutzky Mitglied des Vorstandes der Berliner Konsum-Genossenschaft, seit 1906 hatte er die Funktion des Gauleiters dieser Vereinigung von Berlin. Im Jahre 1914 wurde er zum Vorsitzenden des Verbandes der Gemeinde- und Staatsarbeiter gewählt. Wutzky gehörte 1917-1932 dem Berliner Magistrat als unbesoldeter Stadtrat an. 1919/20 übte er ein SPD-Mandat in der Nationalversammlung aus. Seit dem Jahre 1933 stand Wutzky unter Bewachung der Politischen Polizei (später Gestapo). Nach 1945 war Wutzky Bezirksverordneter in Neukölln, 1949 wurde er Stadtältester von Berlin. Im Jahre 1950 wurde er Vorstandsmitglied der neugegründeten Großeinkaufs- und Verbraucher-Genossenschaft mbH in Berlin. Wutzky wohnte (1955) in Rudow, Straße Nr. 299. Das Ehrengrab von Emil Wutzky befindet sich auf dem Landeseigenen Friedhof Rudow in der Köpenicker Straße.