Walter war Mitglied des Kommunistischen Jugendverbands Deutschlands und trat 1930 der KPD bei. In Berlin-Neukölln wirkte sie als Jugendfunktionärin. Sie absolvierte ab 1930 ein Studium an der Internationalen Lenin-Schule in Moskau und war Mitglied des Zentralkomitees des Kommunistischen Jugendverbands. Ihre erste Verhaftung erfolgte schon im März 1933. Nach ihrer Entlassung aus der Untersuchungshaft war sie im Kabelwerk Oberspree (AEG) tätig. Bereits im Frühjahr 1934 wurde sie erneut verhaftet, doch die Gestapo konnte ihr keine Widerstandsarbeit nachweisen. Sie ging dann als Landhilfe nach Wahldendow (Pommern). Hier wurde sie am 9.10.1935 erneut inhaftiert. Die Gestapo in der Prinz-Albrecht-Straße trieb Margarete Walter am 21.10.1935 in den Tod.