Der Ort ist durch seine Weinlagen (Schloß Johannisberg, Schloßberg, Hölle u. a.) bekannt geworden. Der ursprüngliche Name Bischofsberg leitete sich von dem durch den Mainzer Erzbischof gegründeten Kloster ab, wurde aber seit Ende des 12. Jahrhunderts verdrängt. Das Benediktinerkloster kam 1716 an die Abtei Fulda, deren Abt in den folgenden Jahren das Schloß erbauen ließ. Bei der Säkularisation 1803 fiel es an Nassau-Oranien, 1815 kam es in Besitz der Fürsten Metternich. Das Dorf Johannisberg war zunächst unter der Grundherrschaft des Erzstiftes Mainz, dann des Benediktinerklosters, verfügte aber seit dem 16. Jahrhundert über gerichtliche und kirchliche Selbständigkeit. Johannisberg gehört seit 1971 zu Geisenheim.