Von 1882 bis 1888 besuchte er die Hochschule für Musik in Berlin. Später war von Baußnern Lehrer an der Akademie für Kirchen- und Schulmusik in Charlottenburg. 1891 war er Vereinsdirigent in Mannheim und von 1895 bis 1902 Leiter verschiedener Gesangsvereine in Dresden. Ab 1908 war er Direktor der großherzoglichen Musikschule zu Weimar. Hier wurde ihm der Professorentitel verliehen. 1916 wurde er Direktor des Hochschen Konservatoriums in Frankfurt am Main und seit 1923 ständiger Sekretär der Berliner Akademie der Künste. Bis zu seinem Tode wirkte er als Lehrer für Komposition an der Akademie für Kirchen- und Schulmusik. Er unternahm große Bemühungen um die Wiedererweckung des deutschen Volksliedes. Er komponierte u. a. die Opern "Dichter und Welt", "Dürer in Venedig" (1901) und "Der Bundschuh" (1904) die Sinfonie "Schnittertod" (1922) sowie Chorwerke, Lieder, Orchester- und Kammermusik.